Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RDH13Q8NBN7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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