Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSGALNACT2Q8N6G5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms