Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPAP2Q8IXW5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms