Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLNKQ7Z7G1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLNKQ7Z7G1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms