Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3BQ7Z3V4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3BQ7Z3V4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms