Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13LQ71F56 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13LQ71F56 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13LQ71F56 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13LQ71F56 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13LQ71F56 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MED13LQ71F56 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms