Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW76

ANKS3, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKS3Q6ZW76 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ANKS3Q6ZW76 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ANKS3Q6ZW76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms