Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf139Q6ZV77 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms