Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC129Q6ZRS4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms