Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRSAM1Q6UWE0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms