Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms