Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC8EQ6NSJ5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC8EQ6NSJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms