Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L1Q676U5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms