Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD4Q5VX71 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms