Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GFI1BQ5VTD9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms