Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NHSL1Q5SYE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHSL1Q5SYE7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHSL1Q5SYE7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms