Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FRMPD1Q5SYB0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms