Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP188Q5SRE5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP188Q5SRE5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms