Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC158Q5M9N0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC158Q5M9N0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms