Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB41Q5JT25 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms