Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TDRD12Q587J7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms