Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COBLL1Q53SF7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COBLL1Q53SF7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms