Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC184Q52MB2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC184Q52MB2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC184Q52MB2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC184Q52MB2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC184Q52MB2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms