Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP29Q52LW3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP29Q52LW3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms