Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC38Q502W7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms