Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LONRF3Q496Y0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LONRF3Q496Y0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms