Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIK1Q3SY52 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIK1Q3SY52 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms