Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDRF1Q3B7T1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDRF1Q3B7T1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms