Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC4A8Q2Y0W8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC4A8Q2Y0W8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms