Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC57Q2TAC2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC57Q2TAC2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms