Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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CDO1Q16878 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDO1Q16878 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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CDO1Q16878 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CDO1Q16878 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CDO1Q16878 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CDO1Q16878 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CDO1Q16878 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CDO1Q16878 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CDO1Q16878 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDO1Q16878 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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