Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN1Q16799 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTN1Q16799 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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