Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNAPC1Q16533 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SNAPC1Q16533 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SNAPC1Q16533 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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SNAPC1Q16533 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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SNAPC1Q16533 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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SNAPC1Q16533 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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SNAPC1Q16533 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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SNAPC1Q16533 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SNAPC1Q16533 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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