Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIK5Q16478 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK5Q16478 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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