Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC6Q16204 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC6Q16204 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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