Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
R3HDM1Q15032 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
R3HDM1Q15032 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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