Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms