Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFTN1Q14699 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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