Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDCD11Q14690 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCD11Q14690 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms