Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMC1AQ14683 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMC1AQ14683 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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