Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SQLEQ14534 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SQLEQ14534 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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