Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNQ14247 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNQ14247 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms