Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBE4AQ14139 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBE4AQ14139 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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