Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM29Q14134 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms