Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CKAP5Q14008 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms