Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP1A4Q13733 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP1A4Q13733 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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