Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FHL1Q13642 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms