Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX6Q13608 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms