Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKD2Q13563 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKD2Q13563 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
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