Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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PTPRSQ13332 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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PTPRSQ13332 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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PTPRSQ13332 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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PTPRSQ13332 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PTPRSQ13332 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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PTPRSQ13332 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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PTPRSQ13332 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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PTPRSQ13332 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRSQ13332 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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